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深度解析:二代基因測(cè)序帶來(lái)的腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療時(shí)代新契機(jī)

發(fā)布時(shí)間:2016-05-06 信息來(lái)源:


導(dǎo)讀

醫(yī)學(xué)研究已經(jīng)迎來(lái)了精準(zhǔn)醫(yī)療的新時(shí)代,剛剛還在實(shí)驗(yàn)室中應(yīng)用的工具,轉(zhuǎn)眼之間已經(jīng)被應(yīng)用于臨床研究。隨著第二代測(cè)序技術(shù)及生物學(xué)進(jìn)展,腫瘤治療領(lǐng)域也正在經(jīng)歷迅猛的發(fā)展。



什么是精準(zhǔn)醫(yī)療?

PRECISION   MEDICAL


精準(zhǔn)醫(yī)療(Precision Medicine)是近幾年興起的疾病治療方案,它強(qiáng)調(diào)在治療時(shí)考慮個(gè)人的基因變化,環(huán)境影響,生活方式等。基于患者的遺傳信息的診斷測(cè)試結(jié)合其他分子或細(xì)胞的分析結(jié)果,再針對(duì)性地選擇適當(dāng)和最佳療法。支持技術(shù)包括分子診斷,成像和分析軟件。


主要的技術(shù)進(jìn)步通常會(huì)帶來(lái)超越技術(shù)初始目標(biāo)的創(chuàng)新和改變。第二代測(cè)序(NGS)技術(shù)、各種組學(xué)的應(yīng)用、不斷增長(zhǎng)的計(jì)算能力和日益累積的“大數(shù)據(jù)”,將促進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)在腫瘤學(xué)中的發(fā)展。



癌癥的精準(zhǔn)治療理念

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癌癥的本質(zhì)是多基因的遺傳疾病,隨著腫瘤發(fā)展,癌癥細(xì)胞仍然在不斷地進(jìn)行分裂和增殖積累突變,有高度的異質(zhì)性,其基因組具有不穩(wěn)定性。近年來(lái)我們意識(shí)到癌癥的分類(lèi)按照簡(jiǎn)單的組織部位是不夠的,藥物的單一治療效果也不理想(有效率僅有20%)。比起傳統(tǒng)的病理報(bào)告,基因組測(cè)序信息能提供更加精準(zhǔn)有效的分型診斷。


二代測(cè)序,又名下一代測(cè)序(Next Generation Sequencing,NGS),也叫高通量測(cè)序(High-Throughput Sequencing),是相對(duì)于傳統(tǒng)的桑格兒測(cè)序(Sanger Sequencing)而言的。顧名思義,二代測(cè)序最大的優(yōu)勢(shì)就在于:“高通量”:一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸分子進(jìn)行序列測(cè)定。換言之,可以實(shí)現(xiàn)低成本下的多基因、多位點(diǎn)、多樣本的檢測(cè)。帶著這個(gè)優(yōu)勢(shì),二代測(cè)序在腫瘤臨床中主要進(jìn)入了以下兩大領(lǐng)域:



1個(gè)體化用藥指導(dǎo)


靶向治療現(xiàn)如今已經(jīng)成為腫瘤治療的首要手段,也是二代測(cè)序在腫瘤臨床中的主要應(yīng)用領(lǐng)域。目前,針對(duì)主要癌種的主要靶向相關(guān)基因檢測(cè),很多醫(yī)院病理科均已常規(guī)開(kāi)展。但隨著研究的進(jìn)展,靶向藥物越來(lái)越多,與某一靶向藥物相關(guān)的基因也越來(lái)越多,因此常規(guī)的檢測(cè)項(xiàng)目就有了局限,使用高通量測(cè)序進(jìn)行多基因檢測(cè),尋找更多靶向治療的機(jī)會(huì)已經(jīng)成了很多患者的需求。最新的非小細(xì)胞肺癌NCCN指南中也已經(jīng)推薦多基因檢測(cè)。



2腫瘤風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估


目前,有超過(guò)200種的遺傳性癌癥已經(jīng)被報(bào)道,遺傳性癌癥多是由患者攜帶某種基因異常引起的。因此,提前預(yù)防,早期發(fā)現(xiàn),早期治療則是這類(lèi)人群最好的選擇。



除腫瘤領(lǐng)域之外,二代測(cè)序還可以應(yīng)用于遺傳病檢測(cè)、疑難雜癥研究、婦嬰生育保健、病源微生物等多個(gè)領(lǐng)域。


相關(guān)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示:目前約有2500多種疾病已經(jīng)有了對(duì)應(yīng)的基因檢測(cè)方法,并在美國(guó)臨床合法應(yīng)用,甚至基因檢測(cè)已成為美國(guó)疾病預(yù)防的常規(guī)手段之一。


從二代測(cè)序風(fēng)風(fēng)火火進(jìn)入臨床視野,隨后雖然經(jīng)歷了試點(diǎn)單位成立、取消、規(guī)范化等各種曲折,但其未來(lái)的應(yīng)用、發(fā)展已經(jīng)逐漸明了,成為必然,相信此技術(shù)定能為廣大病理、臨床工作者帶來(lái)更多的幫助!



精準(zhǔn)治療海內(nèi)外動(dòng)向

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美國(guó):

2015年1月奧巴馬宣布了精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃(PMI,Precision Medicine Intiative),2016年度財(cái)政預(yù)算中將有$2.16億的科研經(jīng)費(fèi)用于積極推進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)療,并為精準(zhǔn)醫(yī)療確定了短期和長(zhǎng)期的目標(biāo)。短期目標(biāo)包括在癌癥研究領(lǐng)域不斷擴(kuò)大應(yīng)用。NIH(美國(guó)國(guó)立癌癥研究所)希望基于疾病的基因和生物學(xué)知識(shí),來(lái)尋找新的更有效的癌癥治療方法。長(zhǎng)期目標(biāo)則集中在大規(guī)模引進(jìn)精密醫(yī)藥衛(wèi)生和醫(yī)療保健的各個(gè)領(lǐng)域。美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院計(jì)劃收集包括美國(guó)各地的1萬(wàn)多名志愿者的基因數(shù)據(jù)、生物樣品和其他健康信息。分析大范圍數(shù)據(jù)來(lái)更好的預(yù)測(cè)疾病風(fēng)險(xiǎn),了解疾病是如何發(fā)生的,并改進(jìn)診斷和治療策略。


英國(guó):

政府創(chuàng)新中心將推出一個(gè)“精密醫(yī)學(xué)彈射器”計(jì)劃,-旨在加快精密醫(yī)學(xué)的發(fā)展,2015年10月26日宣布將建立六個(gè)中心,每個(gè)中心將作為英國(guó)的整體網(wǎng)絡(luò)內(nèi)的區(qū)域精密醫(yī)學(xué)活動(dòng)樞紐,在劍橋總部進(jìn)行統(tǒng)籌,以更精確地了解疾病,以及有更可預(yù)測(cè)的、更安全、成本效益高的治療方法。


中國(guó):

2015年3月,科技部召開(kāi)了國(guó)家首次精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)戰(zhàn)略專(zhuān)家會(huì)議,計(jì)劃在2030年前,中國(guó)精準(zhǔn)醫(yī)療將投入600億元,其中中央財(cái)政支付200億元,企業(yè)和地方財(cái)政配套400億元。最近精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃已經(jīng)完成了論證,“十三五”期間將啟動(dòng)“精準(zhǔn)醫(yī)療重點(diǎn)科技研發(fā)計(jì)劃”,并將選擇性地在全國(guó)各個(gè)具備條件和優(yōu)勢(shì)的區(qū)域中的醫(yī)院和社區(qū)內(nèi)建設(shè)示范中心。


展 望

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隨著人類(lèi)對(duì)癌癥認(rèn)識(shí)的不斷加深,精準(zhǔn)醫(yī)療的必要性與迫切性已經(jīng)得到了醫(yī)療界和各國(guó)政府的廣泛重視。未來(lái):表遺傳學(xué)方向?qū)⒗^續(xù)揭示甲基化是如何調(diào)節(jié)基因表達(dá),加深我們對(duì)癌癥的理解。新組學(xué)(蛋白質(zhì)組和代謝組等)可以揭示癌癥生物學(xué)的其他層面,對(duì)進(jìn)一步理解癌癥生物學(xué)和藥物開(kāi)發(fā)有重要作用。臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)整合和標(biāo)準(zhǔn)化將為精準(zhǔn)治療的下一步發(fā)展奠定基礎(chǔ)。未來(lái)的方向?qū)⑹巧飳W(xué),病理學(xué),計(jì)算機(jī)等多學(xué)科的協(xié)作,開(kāi)發(fā)新的分子診斷測(cè)試,進(jìn)一步收集患者測(cè)序數(shù)據(jù)并使其方便共享和搜索,發(fā)展基礎(chǔ)研究到臨床數(shù)據(jù)的整合網(wǎng)絡(luò),建立新的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型等。隨著各項(xiàng)配套技術(shù)的日趨成熟與完善,精準(zhǔn)治療將在癌癥治療中發(fā)揮越來(lái)越重要的作用。我們有理由對(duì)未來(lái)充滿(mǎn)希望。



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